土壤分中心成立于1992年，是中国生态系统研究网络（CERN）中进行土壤联网研究和土壤数据管理的专业分中心。其主要任务是围绕农业可持续发展和生态环境问题，利用3S技术和空间分析模型，在区域和国家尺度上综合研究农田生态系统中养分循环过程、土壤质量时空演变及其环境效应；利用网络和数据库技术，建立区域和国家级土壤科学数据库。同时，土壤分中心承担了CERN土壤长期监测的质量控制工作，包括土壤监测的技术标准和规范的建立，土壤数据的汇总、质量控制和考核，并对野外台站就土壤监测分析方法、数据质量管理和仪器分析进行培训和技术交流。现已建立并开通了土壤质量监测数据库、中国土壤数据库和氮磷钾养分循环研究专题数据库(http://www.soil.csdb.cn)。 
学术带头人及主要研究方向 
杨林章研究员，主任、博士生导师，农业生态系统优化理论与技术 
潘贤章副研究员，副主任、硕士生导师，土壤资源信息系统与遥感应用